肛瘘发炎也可以手术，但一般情况下不建议在肛瘘出现急性发炎时进行手术。因为肛瘘急性发炎时会出现类似于肛周脓肿的症状，炎症也会波及肛瘘瘘管周围组织，导致瘘管周围组织出现充血、水肿，会增加手术时的创伤以及影响术后切口的愈合。

所以，对于一些局部引流相对通畅的肛瘘，可以先采取药物保守治疗。例如口服或者静脉使用抗生素控制局部炎症，再择期行肛瘘手术。

如果经保守治疗局部感染症状仍然比较严重，瘘管内脓液引流不通畅，也可以及时行手术治疗，缓解局部的症状。具体应找专业的肛肠科医生就诊，综合分析后再选择恰当的手术时机。