男性出现生殖器畸形是否能够怀孕，需要看畸形的严重程度。

存在生殖器畸形会影响到生育，但并不一定是完全丧失孕育能力，生殖器畸形首先会导致男女双方的性生活受到影响，无法成功的将精子排出与卵细胞进行结合，就容易影响到孕育能力，所以需要针对生殖器畸形进行积极的治疗。

比较常见的生殖器畸形有输精管的畸形，也有可能是存在尿道下裂表现，所以需要及早的进行手术治疗，选择三级以上医院。