血吸虫病肝硬化的主要病理，是血吸虫虫卵引起的病变，由于成虫、虫卵及机体的免疫反应的相互作用的结果，形成了一个相对复杂的病理状态。

我国主要以日本血吸虫感染为多见，它主要的栖息地在于肝门静脉以及肠系膜静脉，主要损害是肠道以及肝脏。

血吸虫性肝硬化同样会引起门脉高压，可出现食管胃底静脉曲张，脾肿大的程度比一般的肝炎后肝硬化严重。具体的病理类型，血吸虫性肝硬化与肝炎后肝硬化不同之处，在于大部分为小结节性肝硬化，少数为混合性肝硬化。