导致面肌痉挛的病因主要可分为三大类：血管压迫、占位性病变、血流不畅。

首先可能是由于异常的血管压迫面神经根所致，主要是位于临近小脑下部的小脑下前动脉、小脑下后动脉、椎动脉、基底动脉或粗大的静脉血管，甚至是基底动脉瘤。然后也可能是一些位于面神经根部位的占位性病变压迫神经根所致，比如桥小脑角区的肉芽肿、肿瘤或者囊肿、听神经瘤等。

最后，如果脑干出现了梗死灶或多发性硬化等疾病，可能会导致面神经根血液供应不畅，营养供应不足，同样可能会出现面肌痉挛。