脑干出血5ml可能会引起严重后果。

由于脑干是比较重要的部位，如果出血量超过了5ml，可能会导致患者死亡，并且死亡率较高。即便没有死亡，也有可能会留下一些严重的后遗症，会导致患者生活不能自理，严重降低生存质量。

因此，在出现脑干出血的情况后，应当紧急就医进行详细检查，使用脱水药物降低颅压，并且控制患者血压。在必要时还需要进行开颅手术治疗，避免危及患者生命。在术后也要严密观察患者生命体征改变，出现异常情况后需要及时进行处理。