肠白塞病大多出现在白塞病发作期病人，按症状出现频率最多的是腹痛，并于右下腹痛为常见，伴有局部压痛和反跳痛，其次为恶心、呕吐、腹胀、食欲缺乏、腹泻、吞咽困难等，消化道的基本病变是多发性溃疡，可见于自食管至降结肠的任何部位，发生率可高达50%，严重的合并溃疡、出血、肠麻痹、肠穿孔、腹膜炎、瘘管形成、食管狭窄等并发症，严重的可导致死亡。

肠白塞病的治疗主要是支持治疗、药物治疗和手术治疗，目前无特异性的药物治疗，常用药物有氨基水杨酸制剂柳氮磺吡啶。糖皮质激素可在炎症明显时或对氨基水杨酸制剂疗效不好的使用，免疫抑制药包括环磷酰胺、硫唑嘌呤或巯嘌呤。发生肠穿孔的病例应积极手术，腹痛明显、腹部扪及包块以及溃疡较深的，通过内科保守治疗无效的也主张手术切除，由于术后复发率高，有建议对回肠的切除应该充分。

对于剧烈腹痛和便血的急性期要绝对保持安静，给予肠外中心静脉营养或肠内营养剂，注意纠正水电解质平衡紊乱，贫血的可输血，低蛋白血症的适当补充人血清蛋白。经治疗可改善预后，眼、中枢神经及大血管受累的预后不佳。