先兆流产的病因很多，其中染色体异常是流产的最主要的原因，包括染色体数量异常以及结构异常两大类。

其次母体自身的因素，比如患有全身性的疾病，孕妇有心力衰竭、高血压、严重的贫血等。内分泌异常，比如黄体功能不足、甲状腺功能低下等。免疫功能异常，严重的缺乏营养，有不良的生活习惯，吸烟、酗酒、过量饮用咖啡等。

环境中的不良因素，比如甲醛、铅等有害的化学物质。子宫缺陷，比如先天性的子宫畸形、宫腔粘连等。创伤，如果比如腹部受到挤压或者快速的撞击等。情感创伤，比如过度的恐惧、忧伤等。这些都是引起先兆流产的原因。