阴茎根部的皮肤瘙痒原因有很多，有可能是属于会阴部皮肤黏膜的过敏反应所造成的皮炎或者湿疹，会造成皮肤瘙痒，并且伴随皮肤有小疙瘩、皮肤发红肿胀等表现。

另一种原因也有可能是属于滴虫感染或者是阴虱等疾病，也会刺激局部的皮肤，造成阴茎根部瘙痒。

其次，也有可能是由于真菌感染，所造成的局部皮肤癣，也容易造成皮肤瘙痒的症状，有的还会出现渗出液或者是鳞屑样分泌物。

具体是哪一种原因，建议及时去医院进行检查确诊病因，针对性采取下一步的干预措施。无论是哪一种原因造成的，都应该保持皮肤的卫生，勤换内衣、勤洗澡，注意会阴部的通风。