良性葡萄胎和恶性葡萄胎在临床上的主要区别就是恶性葡萄胎的水疱状物质超过了子宫的范围，并且侵入子宫肌层深部组织，或者是其他部位发生相应的转移，最常见的转移部位就是肺部。

而良性葡萄胎在临床上水疱状物质只限于宫腔之内，不会超过宫腔以外，所以在临床上往往不会发生转移，这是两者主要的区别。

在治疗上也有所不同。良性葡萄胎经过清宫手术之后，在临床上监测血HCG如果能够持续性地下降，就建议在临床上继续给予观察，定期随访就可以了。而恶性葡萄胎如果是在临床上出现经过检查发现，如果子宫超过了怀孕5个月大小的情况下，建议可以考虑给予手术进行治疗。