着色芽生菌病一般做检查，主要以真菌境界为主。

可以直接取患处皮肤，用氢氧化钾固定之后，来观察是否有菌丝或孢子，这样对诊断有一定的帮助。有必要的也可以选择做真菌培养，可以看到培养出卡氏枝孢霉菌，或者是紧密着色真菌等诸多真菌种类。

而做皮肤病理学检测是诊断这种着色芽生菌的金标准，可以见到后壁棕黄色孢子，同时有明显的表皮假上皮瘤样增生，还可以见到化脓性肉芽肿性炎症，以及纤维增生机化等诸多表现，就可以确诊。