射精后尿道疼痛可能为慢性前列腺炎所引起，也可能为慢性尿道炎所致，建议及时进行尿常规、前列腺液常规以及尿培养等检查，明确诊断具体的引发原因，制定合理的治疗方案。

如果为慢性前列腺炎所引起，通常需要患者服用通淋利尿、清热利湿的药物，比如三金片、前列腺炎通片等，通常2~4周可彻底治愈。

如果为慢性尿道炎所致，需要患者服用敏感类的抗生素予以治疗，比如头孢呋辛酯片、呋喃妥因片等，治疗周期需要2~3周；在治疗期间患者应避免饮酒、避免吃刺激性较强的食物。