心源性的脑血栓能不能治好，是根据患者损伤的部位和病情来决定的。

有些心源性的脑血栓早期通过有效的治疗，病情会逐渐减轻，甚至不遗留有后遗症。患者脑血栓较重、损伤重要的功能部位，会出现严重后遗症，例如言语不清、饮水呛咳、吞咽困难、眼球凝视，或视物不清、患侧肢体运动，或感觉功能障碍。

严重的患者会出现大脑中动脉或颈内动脉的梗塞，而出现大面积的坏死，出现脑水肿、颅内压增高，甚至脑疝，危及患者生命。心源性脑血栓患者绝大部分不会治愈，通过早起积极治疗，减少致残率。