通常情况下，胆道蛔虫病与肝蛔虫病的鉴别，主要是通过影像学的检查，比如腹部彩超或CT等。检查结果如果是蛔虫在胆管或胆囊里，就属于胆道蛔虫病；如果蛔虫在肝上，就是肝蛔虫病。

胃肠道里的蛔虫由于各种原因，钻入胆道系统，诱发疾病。如果蛔虫在胆道系统中运动活跃，继续向肝内爬行，就会造成肝蛔虫病。因此，肝蛔虫病都是继发于胆道的蛔虫病，而且肝蛔虫病多与胆道蛔虫病并发，而胆道蛔虫病可单发。

除此之外，两者的临床表现基本都相同，做好鉴别才有利于疾病的治疗。