宫外孕药物流产流不干净。而且宫外孕进行药物流产不但不能流干净，反而会加重病情。因为服用药物后胚胎会被杀死在着床的位置，会引起输卵管被堵塞或破裂，引起内出血等现象，反而增加了手术的难度，所以不建议宫外孕进行药物流产。

发现宫外孕时可以通过腹腔镜手术切开输卵管，将胚胎取出，再进行缝合，可以更好地保持输卵管的正常功能，不影响以后怀孕。

术后也要注意身体的恢复，及时补充营养，一个月内禁止同房，避免造成宫内感染或是粘连的发生。