口腔厌氧菌的感染要用抗厌氧菌的药物进行治疗。依据厌氧菌感染轻重，可采用口服、肌注或静脉滴注，主要选择药物如甲硝唑、奥硝唑，还有替硝唑。口腔厌氧菌的感染多见于下面这两种疾病：

1.急性根尖周炎，要考虑开髓，疏通根管，敞开引流。症状缓解以后要进行根管的治疗，症状才彻底消失。

2.颌面部间隙的化脓性感染，这种情况要切开排脓，全身静脉滴注青霉素、甲硝唑、糖皮质激素地塞米松，症状才能够缓解。

另外，要找出引起间隙感染的原发病，进行相应的处理。