口腔厌氧菌感染主要通过药物治疗，根据是否有损伤、破溃的情况，决定具体治疗方式。

如果有破溃，需要先用双氧水冲洗破溃处，清除干净脓液，以免流动到其他部位，引发感染扩散，再局部涂抹甲硝唑软膏促进破溃面愈合，合并有发热者需要口服或静滴抗生素治疗。

如果尚未破溃，但是触摸口腔黏膜红肿处有波动感，应该先消毒口腔黏膜有波动感处，再用手术刀切开引流脓液，再用双氧水清洗切口，涂抹甲硝唑软膏。近三天内饮食以流食为主，避免过烫、过辣的食物刺激，可促进伤口愈合。