脑部有囊肿通常需要采取进一步的观察并定期复查，也有的需要采取手术治疗。脑部有囊肿如何处理通常包括以下的一些方式：

1.对于先天性蛛网膜囊肿以及松果体囊肿，如无进一步增大且没有引起神经功能障碍者，往往可以采取密切观察并且给予定期复查。

2.对于先天性蛛网膜囊肿有可能出现增大，引起头痛、癫痫、脑组织发育障碍或者是出现肢体偏瘫等症状，需要采取手术治疗。

3.对于松果体囊肿，若因为引起脑脊液循环通路受阻，也需要采取手术治疗。

4.脑肿瘤生长可能会伴有囊肿的形成，建议若是良性肿瘤，并且暂时无神经功能障碍发生，可以采取进一步的观察。若为恶性肿瘤，无论是否有神经功能障碍发生，或者是良性肿瘤引起严重的神经功能障碍，均需要采取手术切除肿瘤及囊性的病变。