早期复极综合征和心脏神经官能症的区别主要是症状不同，以及发病年龄和心电图改变不同。

第一，症状不同。早期复极综合征往往没有明显的症状，部分患者会有胸痛以及胸闷症状表现，极少数患者有可能引起心源性猝死发生。而心脏神经官能症的症状表现多，比如心慌、胸闷、胸痛以及头晕、乏力、呼吸困难等，但不会引起猝死现象发生。

第二，发病年龄不同。早期复极综合征可以见于各个年龄阶段，而心脏神经官能症主要见于年轻人和部分更年期女性。

第三，心电图改变不同。早期复极综合征表现为心电图S-T段上抬改变，而神经官能症心电图一般不会有这种改变。