3个月宝宝咳嗽、吐奶，可能是空气比较干燥，加上喝水量不足，咽喉局部干燥出现不适感，引起刺激性的咳嗽。因为宝宝的贲门括约肌发育不完善，咳嗽时很容易引起咽喉反射造成吐奶。

宝宝在吸奶的时候，由于奶液的流出速度比较急会引发呛奶，也可导致咳嗽、吐奶。咽喉发生炎症，由于炎症刺激咽喉，造成咽喉局部充血、水肿，也可引发咳嗽、吐奶。

此外，如果发生支气管炎或者肺部发生炎症造成咳嗽比较剧烈时，也会引起胃肠道反应发生吐奶。