三天两头扁桃体发炎的原因有这几种：

1.在扁桃体发炎时因为用药不当或用药时间不够，导致扁桃体炎症没有彻底治愈，扁桃体炎就会反复发作，最终形成慢性扁桃体炎。而当受到某些因素刺激时，例如烟酒刺激、精神压力大、熬夜上火等，就会导致慢性扁桃体炎急性发作。

2.可能是因为身体免疫力低下造成。多见于儿童，容易出现急性上呼吸道感染，也容易继发扁桃体发炎。

3.可能是因为口腔内其他炎症造成。例如牙龈炎、口腔炎等，也容易对扁桃体造成影响，引起扁桃体反复发炎。