尿路感染、输尿管末端结石、尿道肿瘤等疾病，可能会引起女性上完厕所后有刺痛感。

当患有尿路感染时，病原体在膀胱及尿道大量繁殖，会引起上述黏膜充血水肿，炎性介质、内毒素会刺激末梢神经而引起痛觉阈值降低，排尿膀胱收缩会牵拉膀胱尿道，末梢神经受炎症刺激而出现疼痛。

输尿管肌肉延伸至膀胱及后尿道，当患有输尿管末端结石时，排尿完膀胱及后尿道收缩，牵动输尿管末端的结石在输尿管管腔移动，会引起放射性的刺痛。患有尿道肿瘤，排尿后后尿道关闭，挤压肿瘤会引起尿道刺痛。