巴雷特食管本身并不会引起症状，但是巴雷特食管常见于反流性食管炎的患者。

反流性食管炎常引起反酸、嗳气、腹痛、消化不良、胃部烧灼感、胸骨后疼痛等表现。另外，当进展为食管溃疡或狭窄时，患者还会出现吞咽困难，部分患者还会出现出血、穿孔等并发症，从而引起贫血等临床表现。

巴雷特食管是因为食管下段鳞状上皮被柱状上皮所替代，而出现的一种癌前病变。所以当胃镜检查发现有巴雷特食管时，应该定期复查胃镜。