肛瘘自行消失是因为症状较轻。肛瘘是因为肛窦炎所导致肛周脓肿蔓延到周围皮肤破溃后形成的，一般情况下，肛瘘自行消失的几率较低。

肛瘘分为内口、外口和瘘管，一旦形成肛瘘后，自愈的可能性很小，大多数需要手术根除治疗。早期症状较轻的肛瘘可通过保守治疗，外面用消肿止痛的中药洗剂作用，局部涂抹金黄膏，口服抗生素综合治疗。

症状较严重的要将瘘管切开，与内口一并切除，术后进行抗生素抗炎治疗，注意局部伤口的消毒和换药，防止出现假性愈合。