细菌性肝脓肿是由细菌引起的化脓性感染，又称化脓性肝脓肿。由于肝脏接受肝动脉和门静脉的双重血供，并通过胆道丰富的血供和单核-巨噬细胞系统强大的吞噬作用，可以杀死入侵的细菌，阻止其生长，所以细菌性肝脓肿不常发生。当人体抵抗力较弱时，侵入体内的化脓细菌会引起肝脏感染，形成脓肿。

引起细菌性肝脓肿最常见的病原菌有大肠杆菌、变形杆菌、成人铜绿假单胞菌、儿童金黄色葡萄球菌、链球菌、弗里德兰德肺炎菌等。