醒来头疼得厉害，可能为以下几方面的原因所引起：

1.着凉感冒。由于睡觉时吹电风扇或者是室内温度较低，致使着凉感冒，诱发上呼吸道感染，便可在醒来后出现头痛症状。

2.脑供血不足。当人体处于睡眠状态时，机体的代谢率降低，血流速度相对减慢，容易诱发脑动脉供血不足，进而导致醒来后头痛。

3.睡眠质量差。由于晚上熬夜或者是心理压力过大、精神焦虑、抑郁，致使睡眠质量差，浅睡眠的时间相对较多，导致睡眠不足，大脑不能得到充分休息，也会引起醒来后头痛。