肛门指检主要可以检查肛周、肛管以及直肠下端的一些疾病，主要有以下两大类型：

第一，肛管以及肛门周围的疾病，包括内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛周脓肿、肛裂、肛乳头肥大、肛窦炎、肛门周围恶性肿瘤等，这类疾病可以通过肛门指诊触及柔软以及质硬肿物或者裂口，或者炎性包块等。还可以通过肛门指诊检查患者肛门的松紧程度、是否有肛门狭窄或者肛门失禁。

第二，可以检查直肠下端的一些疾病，通过肛门指诊触及低位的直肠恶性肿瘤、息肉等等，可以判断大小、质地、边界、范围以及位置等信息，可以通过指套是否染血判断直肠内是否有出血。