做完肠镜肚子疼可能是以下几种情况导致的：

首先，电子结肠镜检查是一项有创的检查，操作过程中可能会接触肠道黏膜，导致肠道黏膜水肿，患者可能会出现肚子疼的表现，这种情况很常见，不用过度担心，一般两到三天后能够缓解。

其次，可能是做肠镜过程中损伤了肠道黏膜，如果患者同时出现了大便发黑或解血便的情况，要警惕是不是出现了消化道出血。

此外，如果在肠镜下做镜下治疗，比如EMR、ESD，患者往往会出现肚子疼或腹部不适。因为治疗时会形成创面，这类患者可以密切观察，一般也能自行缓解。