血管性偏头痛的病因尚不明确，可能与下列因素有关，约60%的偏头痛病人有家族史，其亲属出现偏头痛的风险是一般人群的3～6倍。家族性偏头痛患者尚未发现一致的孟德尔遗传规律，反映了不同外显率及多基因遗传特征与环境因素的相互作用。

本病女性多于男性，多在青春期发病，月经期容易发作，妊娠期或绝经后发作减少或停止。这提示内分泌和代谢因素参与偏头痛的发病，偏头痛发作可由某些食物和药物诱发。

食物包括含酪胺的奶酪、含亚硝酸盐防腐剂的肉类和腌制食品、含苯乙胺的巧克力、食品添加剂，如谷氨酸钠、红酒及葡萄酒等。