乙肝病毒携带者转阴后还是会转阳。

乙肝病毒携带者都属于慢性肝病患者，所以乙肝表面抗原绝大部分都会持续阳性。只有极个别患者可能会出现乙肝表面抗原短暂性出现阴性的情况，但是不久又会出现再次阳性。因为乙肝病毒携带者的肝细胞内已经整合有乙肝病毒的环状闭合DNA。整合在肝细胞内的这部分病毒核酸可以不断的组装产生乙肝表面抗原，然后穿透细胞膜进入到血液中，导致乙肝五项中乙肝表面抗原出现阳性。

因此，乙肝病毒携带者转阴后还是会再次出现阳性。