怀孕以后发现有囊肿时，要根据囊肿的大小和症状，判断治疗方案。

如果囊肿体积比较大，而且增长的速度快，应该及时进行手术切除，防止恶变的可能。如果囊肿暂时没有明显的体积变化，并且没有不适感，可以先保守治疗，以观察为主，并且胚芽正常发育，也不用做流产手术。

如果囊肿突然出现扭转或者出现感染的风险时，要及时做手术将囊肿切除。要在医生指导下，结合实际情况，来断定是否需要手术。要定期检查卵巢囊肿和胎儿的情况，确保胎儿和孕妇的健康。