三个月没来月经可能有危害，如不孕症、甲状腺功能亢进症、子宫内膜息肉等疾病。也可能没有危害，如怀孕时也会出现停经的情况。

1.不孕症。如果三个月没来月经，排除了怀孕可能，多提示卵巢有疾病而不能正常排卵，卵子与精子不能结合形成受精卵，就容易导致不孕症。

2.甲状腺功能亢进症。三个月没来月经，提示患者体内的雌孕激素水平出现异常，会影响到甲状腺的正常分泌功能，导致其甲状腺激素分泌过多，而表现为甲状腺功能亢进症。

3.子宫内膜息肉。当体内的雌激素和孕激素水平同时达到高点时，患者会出现月经来潮的情况。但因为没有孕激素的刺激而导致月经未来时，患者体内的雌激素水平过高，会刺激子宫内膜使其增长过速，而出现子宫内膜息肉。