三个月没来例假了肯定是有危害的。对于年轻女性，如果三个月没来月经，往往是因为孕激素不够，会抑制排卵，长期的雌激素刺激子宫内膜，缺乏孕激素拮抗，会导致子宫内膜增生，甚至出现不典型增生以及子宫内膜癌风险增加。

三个月不来月经，对于有生育要求的女性，会明显的影响怀孕，会导致不孕、不育。如果是因为卵巢功能衰竭导致三个月不来月经，就会出现一系列的低雌激素症状，会导致潮热出汗，甚至会出现一些植物神经紊乱的症状，会影响生活质量。

如果三个月不来月经，应该及时到医院里检查，查找不来月经的原因，进行针对性的治疗。