任何手术都会产生相应的并发症或后遗症，有些后遗症是不需要治疗，随着时间的推移，可以慢慢缓解或治愈的，而有些后遗症是不可逆性的损伤，会对生活质量造成一定的影响。

对于胆结石手术的患者来说，最常见的短期内手术后遗症主要是消化系统的改变，因为胆囊是贮存浓缩胆汁的器官，胆汁对食物尤其是脂肪的消化密切相关，胆囊摘除后，会在短期内影响人体的消化和吸收，部分患者会出现腹胀，恶心呕吐，食欲不振等症状，但是随着机体的适应和结构性的代偿，比如胆管扩张，可适量增加胆汁的储备，患者的症状可逐渐消失。

对于术后胆管梗阻或狭窄的患者，通常需要再次手术治疗。