慢性肾炎疼痛的处理需要根据不同的病因，选择不同的治疗方法。

1.如果明确疼痛是由于慢性肾炎本身疾病所致的，除了疼痛以外，患者还可以出现肉眼血尿、蛋白尿、高血压等症状。需要进行降血压、低钠饮食、限制蛋白质摄入、休息、个人防护、避免劳累，及感染等方法来控制原发病减轻疼痛。

2.慢性肾炎患者如果合并有腰椎间盘突出症以及肾结石，也可以出现肾区疼痛不适。如果腰椎间盘突出可以采取针灸、推拿、口服中药、小针刀等方法缓解。如果肾结石引起的疼痛，可以通过排石药物，或者体外冲击波碎石治疗缓解疼痛。