手指上长透明小水泡最常见的是出现手癣，如果手部皮肤感染皮肤癣菌，容易导致手癣，如果是水泡型的手癣会有手部出现小水泡伴丘疹、红斑、瘙痒，有些还会伴有脚癣，通常手足癣容易同时发生。

手指长透明的小水泡也有可能是出现汗疱疹，汗疱疹会在手掌，或者手指头两侧出现深在性的小水泡，会出现脱皮、瘙痒的情况。

出现手指长透明小水泡，也有可能是病毒感染导致，如手部和脚部都会有小水泡，伴有疼痛等，常见手足口病。