肛窦炎即肛隐窝炎，由于其解剖及生理特点，粪便及细菌，极易积存在窦里，引起肛隐窝炎。并沿肛门腺导管和肛门腺蔓延、扩散。肛门病中，许多疾病与肛窦炎有直接的关系。如肛门直肠周围脓肿、肛瘘、肛裂、肛乳头炎等。

肛乳头炎是由于肛窦炎引起的一种疾病。这是由于肛窦两旁就是肛乳头。肛窦炎后首先侵及肛乳头，引起肛乳头炎，使之肿胀肥大。这二者常同时存在，在肛乳头炎症状及治疗上有许多类似之处。