半夜发烧体温39℃，往往需要及时去医院就诊，给予相应干预。

首先，半夜发烧39℃多见于感染性疾病，感染性的疾病需要及时给予控制。否则病情进展有可能会导致呼吸衰竭、休克等相关并发症，甚至有可能危及生命。因此，半夜发烧39℃，应该立即就诊，查血常规，甚至胸部CT等相关的检查。

如果考虑是细菌性感染导致的，往往需要尽早使用抗生素进行治疗。此外，可能还需要同时抽取血培养等病原学检查，以辅助判断病情，指导治疗。还需要积极退烧、对症治疗，因为高烧的时候有可能引起脱水，导致血液黏稠，甚至有可能会诱发脑血管病等相关并发症。

另外，在退烧治疗的同时，还需要适当多饮水，甚至静脉补液治疗，以预防脱水现象。