女性经期出现偏头痛的原因，在医学上尚没有完全明确，考虑是和月经期女性体内雌激素、孕激素等激素水平的波动，刺激了颅内疼痛敏感结构有关系。

偏头痛的发生是患者的易感基因和环境因素相互作用之后，导致了大脑的神经系统功能失调、三叉神经产生了异常的冲动，引起了偏头痛的症状。

偏头痛的女性患者比较多，一般都是在月经开始前或者月经期发作，在更年期之后逐渐的减轻消失。提示女性月经期，体内激素的波动和偏头痛的发生有相关性，更详细的原因还有待进一步研究。