肛瘘分泌物很臭是因为伴有细菌感染引起的。

当患有肛周脓肿没有及时治疗而自行破溃，或者仅行切开引流术时，肛周脓肿的急性炎症会逐渐变成慢性炎症，逐渐形成肛瘘。肛瘘不会自愈，可引起肛周反复的肿痛、破溃、流脓。肛瘘是由内口、外口以及皮下瘘管组成，未发作时仅可触及肛门皮下有条索状的斑痕。当内口受到细菌感染引起化脓，脓液会顺着瘘管从外口溢出。由于致病菌通常为大肠杆菌，因此，脓液常伴有阵阵的恶臭。

肛瘘一旦确诊后，应及时进行手术治疗。