肛瘘术后的分泌物大多为切口分泌物：

首先，由于大多数的肛瘘手术切口为开放切口，而开放切口表面没有皮肤的保护，会有持续的渗出而形成分泌物。

其次，由于手术时一些创伤性医疗器械的使用，例如电刀，会对肛瘘手术创面造成热损伤，而术后早期切口表面会有坏死组织附着，逐渐溶解、脱落也会产生分泌物。

再次，肛瘘手术切口和直肠内是直接相通的，一些肠道内的粪水以及肠道粘液会通过切口流出，也会导致分泌物。

肛瘘术后有分泌物属于正常现象，待术后切口愈合以后症状会消失。