骨样骨瘤晚期患者临床常见胫骨疼痛、软组织肿胀、肌肉萎缩、脊柱侧弯、关节疼痛、骨痛等症状。

疼痛症状一般出现的比较早，起初为间歇性的疼痛，服用止痛药可以减轻，随着疾病进展，后期疼痛可有加重并且呈持续性，止痛药不能使疼痛症状缓解。

疼痛可以放射至附近关节，同时还会伴有血管运动性反应，比如皮温增高、多汗等。

骨样骨瘤晚期患者在骨未成熟时可能会出现肌肉萎缩、骨骼畸形等症状，位于关节内的骨样骨瘤可出现关节局部压痛，活动受限等症状。