载脂蛋白CII是乳糜微粒、极低密度脂蛋白和高密度脂蛋白的结构蛋白之一，载脂蛋白CⅡ为含79个氨基酸残基的单链多肽，分子量为9.1kD，先合成的载脂蛋白CⅡ含有101个氨基酸残端，其中 22个氨基酸构成信号肽，除去信号肽后则转变为成熟载脂蛋白CⅡ，载脂蛋白CII其氨基酸组成有3个特点:：

1.缺乏组氨酸和半胱氨酸。

2. 含有较多的极性氨基酸。

3.苏氨酸及丝氨酸较高。

载脂蛋白 CⅡ具有促进乳糜微粒和极低密度脂蛋白降解的作用，还具有抑制肝脏对乳糜微粒和极低密度脂蛋白摄取的作用，可能参与血浆中脂蛋白残粒的清除过程，也能激活卵磷脂胆固醇酰基转移酶。