慢性骨髓炎和骨样骨瘤的主要区别有以下几点：

第一，引起的病因的不同。慢性骨髓炎主要是因为血行播散，或者是局部的开放性骨折的伤口长期出现感染，从而导致的局部的慢性炎症，而出现有骨质的破坏、增生等的病变。而骨样骨瘤主要是，局部骨头出现原发性的肿瘤而导致。

第二，症状的不同。慢性骨髓炎主要是表现为局部骨髓炎症的地方，会出现长期的疼痛，而且伴随着周围软组织的红肿、热痛，或者甚至会出现有软组织有脓肿形成，有炎性分泌物等表现。而且还有可能会伴随着有全身性的症状，例如是低热、乏力等表现。骨样骨瘤除了疼痛之外并没有全身的症状，有部分的骨样骨瘤甚至也不会出现疼痛。

第三，X光片的表现。慢性骨髓炎主要是表现为有骨质的破坏与增生。而骨样骨瘤主要是表现为有局部的骨性肿瘤的形成。