新冠病毒可以存在于患者的体液以及分泌物当中，肠液当中可以检出活性新冠病毒，所以肠镜检查在理论上存在感染的可能性。但是目前正规医院进行肠镜检查之前，都会进行预防工作。其预防工作主要包括两点：

首先，针对每一个做肠镜的人员，都会常规进行体温检测，如存在发热体征，则通常需要进行核酸检测。除外新冠病毒感染后，才可以进行肠镜的检查。

其次，肠镜检查都会对肠镜进行消毒，新冠病毒在常规消毒下大多能够灭活，所以肠镜检查传播新冠肺炎的可能性很低。