乙肝E抗原阳性并不是需要治疗的指征，同时也没有可以使乙肝E抗原转阴的特效药物，乙肝E抗原阳性是否需要治疗，要结合肝功能和乙肝病毒DNA结果。

首先乙肝E抗原阳性需要检查肝功能和乙肝病毒DNA载量。如果肝功能正常，即便乙肝E抗原滴度很高、乙肝病毒DNA载量很高也不需要特殊治疗，只需要长期随访肝功能即可。

如果肝功能转氨酶升高达到2倍正常上限以上，且乙肝病毒DNA大于10的5次方，再加上乙肝E抗原阳性，则需要抗病毒治疗。抗病毒治疗的方案目前有两种，一种是干扰素，另一种是核苷类似物，观察治疗效果的其中一项指标就是乙肝E抗原转阴并出现乙肝E抗体阳性。