乙肝e抗原是由乙肝病毒c基因区编码的一种蛋白，乙肝e抗原降低就表示乙肝病毒的数量减少，它通常表示患者乙肝病毒复制能力下降、活跃度降低、传染性减小。

在临床上，通常有两种情况可以看到乙肝e抗原的降低，一种是急性乙肝，自身免疫系统清除乙肝病毒，乙肝e抗原会由高滴度逐渐降低，最后转阴，然后出现乙肝e抗体。另一种情况是乙肝慢性感染，乙肝慢性感染经过干扰素或者核苷类似物抗乙肝病毒治疗后，病毒数量减少。由此可引起乙肝e抗原滴度下降最后逐渐转阴，直至出现乙肝e抗体。所以乙肝e抗原降低对于慢乙肝患者是表示治疗乙肝有效的指征，也是临床上抗乙肝病毒的目标之一。