喉咙长疱、发烧的症状，可能与下列因素有关：

1.疱疹性咽峡炎。患者在患上疱疹性咽峡炎，由于肠道病毒等的感染，就会导致患者的喉咙部位出现明显的疱疹的表现。而病毒的入侵又会造成身体的免疫力出现免疫应答反应，从而调高人体的体温，就会进一步有发热的表现出现。

2.手足口病。患上手足口病的患者，也会出现明显的喉咙部位长疱以及发烧等的异常症状。但是此类患者主要是以儿童为主，且症状除了喉咙长疱以外，还会表现为口腔内以及手部和足部等部位也出现水疱的情况。