孕妇的衣原体在转阴后还是有可能会复发的。如果孕妇在衣原体转阴后仍然接触了衣原体的感染原，就有可能会出现衣原体感染复发的现象。例如，如果孕妇发生了孕期性生活，而性伴侣的阴茎等部位本身有衣原体的感染，在发生性行为的时候也没有进行相关防护就有可能再次感染衣原体。

或者孕妇的家人等有衣原体感染的情况，而孕妇使用了病人使用过的毛巾或者是衣物等用品，也有可能会再次造成衣原体感染的现象。

因此，孕妇衣原体转阴后要严格注意，避免再次交叉感染的情况出现。