沙眼衣原体经过1~3个月的治疗大多可以转阴。

沙眼衣原体是一种微生物，具有多种类型，能够感染人体导致多处组织发生炎症。当沙眼衣原体感染结膜时，会造成感染者出现沙眼。患者眼睑上会出现很多滤泡，随着病情进展，眼睑上会出现很多瘢痕组织，并引起一系列的并发症。沙眼衣原体通过某些药物，如抗生素、抗衣原体药物治疗以后，一般3~4周可以实现对沙眼衣原体的控制，局部需要继续用药大概6~8周来实现沙眼的彻底治愈。

沙眼衣原体清除以后，患者转为阴性，此时要根据沙眼衣原体带来的后遗症进行针对性的治疗。