肛瘘做手术之前一般做实验室检查，主要是血常规、肝肾功能、血脂、血糖、感染八项、血凝相关的检察。

如果怀疑肛瘘有可能癌变，则需要检察肿瘤标志物、心电图和相关的影像科检察，包括胸部拍片、肛周CT和磁共振。

如果患者同时患者有免疫力低下、结核病和恶性肿瘤的情况下，建议检测针对性强的相关检察，避免围手术期发生原发病加重，引起原发病加重和死亡的情况。术前风险评估很多情况下依赖于各种辅助检查，所以一定不可替代或者不检查，以免术中、术后出现严重的并发症。